V rámci reorganizácie SLOVENSKÉHO VODOHOSPODÁRSKEHO PODNIKU, štátneho podniku nastala zmena územného členenia podniku. V súčasnej dobe je správa  územia zabezpečovaná prostredníctvom šiestich odštepných závodov: Povodie Dunaja, Povodie dolného Váhu, Povodie horného Váhu, Povodie Hrona,  Povodie Hornádu a Povodie Bodrogu, zriadených na báze prirodzených povodí.