Do územnej pôsobnosti Povodia Hornádu, odštepného závodu patrí čiastkové povodie Slanej, číslo hydrologického poradia 4-31, čiastkové povodie Hornádu, číslo hydrologického poradia 4-32, čiastkové povodie Bodvy, číslo hydrologického poradia 4-33 a čiastkové povodie Dunajca a Popradu, číslo hydrologického poradia 3-01.

Územná pôsobnosť závodu je vymedzená na severe štátnou hranicou s Poľskou republikou, z východu rozvodnicou medzi čiastkovým povodím Hornádu a čiastkovým povodím Bodrogu a z juhu štátnou hranicou s Maďarskou republikou. Na západe hranicu územnej pôsobnosti Povodia Hornádu, odštepného závodu tvorí rozvodnica medzi čiastkovým povodím Slanej a čiastkovým povodí Ipľa, pokračuje po rozvodnici čiastkového povodia Hornádu a čiastkového povodia Hrona až na vrch Kráľova hoľa v Nízkych Tatrách. Z Kráľovej hole pokračuje hranica územnej pôsobnosti Povodia Hornádu, odštepného závodu na sever po rozvodnici povodí vodných tokov Čierny Váh a Hornád a po rozvodnici povodí Bieleho Váhu a Popradu k štátnej hranici s Poľskou republikou, ktorá tvorí severnú hranicu územnej pôsobnosti Povodia Hornádu, odštepného závodu.